Desde su creación en enero de 1996, ONUSIDA, el Programa Conjunto de las Naciones Unidas sobre el VIH/SIDA, ha asumido la responsabilidad dentro del Sistema de las Naciones Unidas de colaborar con los países a fortalecer sus capacidades para hacer frente a la epidemia del VIH/SIDA. Diez agencias se han convertido en sus copatrocinadores a nivel mundial: UNICEF (Fondo de las Naciones Unidas para la Infancia), PNUD (Programa de las Naciones Unidas para el Desarrollo), UNFPA (Fondo de Población de las Naciones Unidas), ONUDD (Oficina de las Naciones Unidas contra las Drogas y el Delito), OIT (Oficina Internacional del Trabajo), ACNUR (Alto Comisionado de las Naciones Unidas para los Refugiados), UNESCO (Naciones Unidas para la Educación y la Cultura), OMS (Organización Mundial de la Salud), Banco Mundial, PMA (Programa Mundial de Alimentos).
El objetivo de ONUSIDA es catalizar, fortalecer y dirigir las habilidades, recursos y redes de influencia que cada una de estas agencias ofrece. Trabajando en conjunto a través de ONUSIDA, los copatrocinadores pueden avanzar mas allá mediante alianzas estratégicas con otras agencias de las Naciones Unidas, con los gobiernos, agencias de cooperación, instituciones religiosas, redes de personas viviendo con VIH/SIDA y organizaciones no gubernamentales (ONG).
A nivel país ONUSIDA trabaja a través de Grupos Temáticos de las Naciones Unidas sobre el VIH/SIDA (GT) y de los Equipos Conjuntos de las Naciones Unidas sobre VIH/SIDA, compuestos por los representantes y puntos focales de VIH/SIDA de las diferentes agencias copatrocinadoras, y otras agencias de las Naciones Unidas como el CINU, UNIFEM Y OIM, en articulación con las contrapartes nacionales.